Sinh ra tại Thành phố New York và lớn lên tại Sunnyside, Queens và sau đó tại quận Westchester, Benh Zeitlin bắt đầu sự nghiệp làm phim khi mới 6 tuổi khi anh và một người bạn thực hiện một bộ phim về Batman. Anh tiếp tục làm phim khi còn là một đứa trẻ trước khi theo học tại Đại học Wesleyan, nơi anh học chuyên ngành phim. Sau khi tốt nghiệp, Benh đã spend một mùa hè tại Prague làm việc với một nghệ sĩ hoạt hình nổi tiếng. Trở lại Mỹ, anh đã làm việc tại một trường tư ở Manhattan giúp các học sinh tiểu học tạo ra các bộ phim ngắn.