Michael Anderson sinh ra ở Huron, South Dakota, vào lúc 10:30 tối, trong đêm Halloween. Ông bị ảnh hưởng bởi một chứng dị tật di truyền gọi là Osteogenesis Imperfecta, nên lớn lên trong chiếc xe lăn. Sau khi tốt nghiệp trung học, ông đi khắp nước Mỹ, hát cho tiền boa và sống trong xe ô tô của mình. Trong sáu năm, ông học tại Đại học Colorado, nơi ông theo học nhiều môn học khác nhau, từ triết học đến sinh học vi sinh. Sau khi học đại học, ông bắt đầu làm việc cho Martin Marietta, giải quyết sự cố máy tính của N.A.S.A trong hệ thống hỗ trợ mặt đất của tàu con thoi. Trong thời gian này, ông làm một bộ phim tài liệu "Little Mike", đã giành được huy chương bạc tại Giải thưởng phim và truyền hình quốc tế. Không lâu sau đó, ông chuyển đến thành phố New York, nơi sự nghiệp điện ảnh và truyền hình của ông bắt đầu. Trong nhiều năm, Anderson được biết đến nhiều nhất trong số những người hâm mộ của đạo diễn David Lynch vì công việc của mình với tư cách là một nhân vật mơ mộng nói ngược trên bộ phim truyền hình cult yêu thích Twin Peaks (1990). Anderson cũng làm việc với Lynch trong tác phẩm biểu diễn thử nghiệm Industrial Symphony No. 1: The Dream of the Brokenhearted (1990) và bộ phim truyền hìnhMulholland Drive (2001). Anderson đã nhận được sự công nhận và thành công hơn nữa trong những năm gần đây nhờ công việc của mình trên loạt phim H.B.O Carnivàle (2003).
